Nový firmware iOS 4.0.2 opravuje chybu zabezpečení, která umožňovala napadnout telefon přes škodlivé přílohy PDF. Tuto chybu využívá například metoda JailbreakMe, která umožňuje instalování neoficiálních aplikací - více zde.
Firmware, snižující bezpečnostní riziko, je dostupný pro nový iPhone 4 stejně jako pro modely 3GS a 3G. Bezpečnostního opatření se dočkaly také přehrávače iPod Touch druhé a třetí generace. Pro tablety iPad je k dispozici nový firmware iOS 3.2.2.